在使用中，样品室的污染是经常会遇到的，如不采取必要的措施，会直埴接影响到测试的正常进行，严重的情况甚至会造成仪器损坏，所以需要特别注意保护样品室不受样品污染。通常来说，需要注意的污染源如下。

　　(1)固体污染  主要是粉末污染，例如，高发光效率的发光粉末落在样品室，如果测量弱发光样品的时候就会干扰测试，需要特别留意。夹好的样品放人前，用洗耳球吹一下，可以减少洒落。

　　(2)液体污染  在取放样品时样品池中的液体若不小心溅到样品室里，要及时进行清洗。

　　(3)气体污染  具有腐蚀性的酸性气体，对于光学元件的污染是不可逆的，直接影响到仪器的使用寿命。在测试此类气体时，样品室需要和周边的光学元件隔离，采用光学窗口保证测试正常进行。比如日立仪器公司生产的荧光仪其机型设计就是隔离式的，而爱丁堡仪器公司生产的荧光仪机型设计属于开放式，就不用来测此类样品。

　　(4)指纹污染  当狭缝开到比较大的时候，留在样品仓上的指纹、汗液可能会发光，影响测试，请在测试时戴上手套。

　　(5)水汽污染  做液氮低温或变温低温时，会导致窗口表面水汽凝结，影响测量数据，可以用于燥空气或氮气吹扫样品仓，驱走水汽。